Окончила в 1981 г. кафедру технологии микробиологических производств Московского химико-технологического института им. Д.И. Менделеева по специальности «Технология микробиологических, ферментных и витаминных производств». С 1981 по 1984 г. обучалась в очной аспирантуре на кафедре микробиологических производств Московского химико-технологического института им. Д.И. Менделеева. В 1985 году защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата химических наук по специальности 03.00.23 – биотехнология. В ИФАВ РАН работает с 1995 года. С 1998 по 2008 гг. работала в лаборатории количественной связи структура-активность (отдел компьютерного молекулярного дизайна) в области QSAR. С 2008 г. по июнь 2014 г. работала в должности научного, а затем – старшего научного сотрудника лаборатории информационных технологий ИФАВ РАН. С 1 июля 2014 года по декабрь 2016 года являлась руководителем группы информационного обеспечения ИФАВ РАН. С 1 января 2017 – руководитель Отдела информации ИФАВ РАН.
По инициативе и под руководством начальника Отдела информации Е.В. Бовиной группа программистов ИФАВ РАН (С.В. Трепалин, А.В. Ярков и П.А. Бовин) разработала базу данных публикаций сотрудников ИФАВ РАН. Поиск публикаций сотрудников института по различным внешним базам литературных данных выполняет главный специалист Отдела Б.В. Леднев, наполнением базы данных и анализом публикационной активности института занимается начальник Отдела Е.В. Бовина. База данных позволяет проводить выборку литературных источников по различным полям, а результаты поиска экспортировать в форматы MS Word и Excel. С помощью разработанной базы данных оценивается результативность научной деятельности ИФАВ РАН.
Татьяна Михайловна Серова, кандидат химических наук, ведущий инженер. Константин Валерьевич Балакин, Главный научный сотрудник, доктор химических наук. E-mail: balakin@ipac.ac.ru
Окончил в 1993 г. с отличием кафедру химии и технологии тонких органических соединений Московского Института Тонкой Химической Технологии им. М.В. Ломоносова по специальностям химия и технология тонкого органического синтеза, биотехнология. В 1996 г. окончил аспирантуру при Институте Биоорганической Химии РАН (ИБХ РАН) им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова, Москва (специальность – биоорганическая химия). С 1998 – кандидат химических наук (специальность – биоорганическая химия), с 2005 – доктор химических наук (специальность – органическая химия). Руководитель и участник ряда исследовательских проектов в области органической, биологической и биоорганической химии, химической информатики. Автор более 100 научных рецензированных публикаций, включая обзоры и главы в книгах. Научный редактор книги издательства Wiley (Pharmaceutical Data Mining: Approaches and Applications for Drug Discovery. Edited by Konstantin V. Balakin. For inclusion in the series: Technologies for the Pharmaceutical Industry, A John Wiley and Sons book series edited by Sean Ekins, University of Maryland. 2009).
Работает в ИФАВ РАН в должности инженера, выполняет обязанности системного администратора института. Занимается технической поддержкой серверов, отвечает за бесперебойную работу Интернет, электронной почты и веб-сайта ИФАВ РАН.
Борис Владимирович Леднев, главный специалист. E-mail: bobka@ipac.ac.ru
Окончил МИТХТ им. Ломоносова в 1980 г. по специальности «Химия и технология нефтехимического синтеза». В ИФАВ РАН работает с 1981 г., с 1998 г. — в лаборатории специального органического синтеза, с мая 2008 г. — в лаборатории научно-информационных технологий в медицинской химии. В настоящее время работает в области создания баз данных научной литературы и информационного анализа по широкому спектру физиологически активных соединений, квалифицированно работает с научной периодикой, а также оказывает консультативную помощь сотрудникам института по проблемам, связанным с поиском данных в различных интернет-ресурсах. Выполняет работы по метрологии публикационной активности ИФАВ. Является ответственным исполнителем от ИФАВ РАН по работе с ресурсом e-library.
Отдел информации создан Приказом по ИФАВ РАН 16 декабря 2016 года. Основными задачами Отдела являются своевременное, полное и качественное информационное обеспечение научных исследований, содействие в подготовке и оформлении отчетов по НИР, нормативно-методических и других документов и отчетов, касающихся деятельности института; организация и проведение работы по пропаганде достижений института, внедрению результатов научно-исследовательской и нормативно-методической деятельности.
Функции Отдела – обеспечение руководителей структурных подразделений и специалистов института информационными материалами об отечественных и зарубежных достижениях науки и передового опыта в целях оказания содействия в выполнении научно-исследовательских работ; обеспечение подготовки нормативно-методических материалов и повышения их эффективности; обеспечение информационной поддержки подразделений института в подготовке тематических обзоров о состоянии и тенденциях развития основных направлений деятельности Института.
Отдел принимает участие в пропаганде достижений института, отечественной и зарубежной науки, передового опыта при проведении конференций, семинаров, лекций, выставок, стендов по отдельным научным проблемам и направлениям; в подготовке и представлении в установленном порядке информационных (отчетных, статистических и др.) материалов в вышестоящие органы; в реализации утвержденных перспективных и годовых планов института.
Работа Отдела включает в себя организацию поиска и систематизации научно-исследовательской, методической информации на основе изучения научной, организационно- и нормативно-методической, другой специальной литературы, а также информационных и документальных материалов, включая отчеты по научно-исследовательским работам, нормативную документацию и материалы конференций совещаний, семинаров и т.п., Интернет ресурсы, с целью извлечения наиболее существенных и значимых сведений, оперативного доведения информации до сотрудников института; справочно-информационное обеспечение отдельных ученых и специалистов, предприятий, учреждений, организаций (юридических и физических лиц) в интересах института (пропаганда достижений), а также обеспечение представления необходимой научной, нормативно-методической информации в соответствии с порядком межотраслевого (межведомственного) обмена информационными материалами.
Отдел руководит предпечатной подготовкой к изданию реферативной, библиографической и обзорной информации о состоянии и перспективах развития науки по тематическим направлениям работы института, а также подготовкой к публикации научных трудов, сборников научных работ, материалов научных и научно-практических конференций, методических рекомендаций, других документов.
Одной из задач Отдела является техническая поддержкой серверов, а также бесперебойная работа Интернет, электронной почты и веб-сайта ИФАВ РАН.
Научно-образовательный центр по медицинской химии образован на базе кафедры органической химии Химического факультета МГУ и Института физиологически активных веществ РАН. Фактически он существует с 1997 года. Организатором и идейным вдохновителем Научно-образовательного центра по медицинской химии является академик РАН Николай Серафимович Зефиров.
Руководитель НОЦ по медицинской химии кандидат химических наук Радченко Евгений Валерьевич e-mail: qenie@qsar.chem.msu.ru.
Целями НОЦ по медицинской химии являются следующие:
Совместная подготовка научных кадров для работы в научных и учебных учреждениях, а также промышленных организациях, связанных с проблемами медицинской химии.
Методическое обеспечение выполнения курсовых и дипломных работ, связанных с проблемами медицинской химии (тематика работ, научно-экспериментальная база, научное руководство).
Разработка и чтение спецкурсов по медицинской химии, в частности, обучение методам направленного синтеза, дизайна и исследования свойств физиологически активных веществ, разрабатываемых для нужд медицины.
Вовлечение студентов в научную работу по фундаментальным и прикладным аспектам медицинской химии.
Обеспечение научной базы аспирантских работ, выполняемых в области медицинской химии.
В работе со студентами и аспирантами заняты профессора и научные сотрудники как Химического факультета МГУ, так и ИФАВ РАН. В научно-образовательном центре по медицинской химии читаются следующие обязательные курсы:
1) Медицинская химия;
2) Компьютерное моделирование и QSAR;
3) Направленная модификация структур физиологически активных соединений на основе лидирующих ФАВ;
4) Комбинаторная химия и ее роль в аналоговом синтезе
и следующие специальные курсы: 1) Оптическая активность, связь с физиологической активностью;
2) Гетороциклические азотистые основания как физиологически активные соединения;
Дата основания Группы ферментативных процессов патологических состояний 1 февраля 2020 года
Дата основания Лаборатории биохимии патологических процессов 1 января 2022 года
Маргарита Евгеньевна Неганова
Заведующая Лабораторией биохимии патологических процессов Тел. +7 496 524-26-06
Основные направления исследований
1. Постановка методов анализа ферментативной активности и свойств ферментов, участвующих в развитии патологии онкологических и нейродегенеративных заболеваний.
2. Изучение влияния биологически активных веществ, в частности, природного происхождения, на ферментативные процессы с целью поиска мишень-ориентированных потенциальных лекарственных препаратов.
Окислительный стресс: Оценка ферментативной активности в условиях окислительного стресса при реализации свободно-радикальных процессов.
Окислительное фосфорилирование: Оценка респирометрической функции митохондрий и анализ работы компонентов дыхательной цепи данных органелл.
Гликолиз: Исследование действия на гликолиз – основное энергетическое состояние опухолевых клеток, как на процесс в целом, так и ключевые ферменты данного метаболического пути.
Гистоновые деацетилазы (HDACs): Анализ работы ферментов гистоновых деацетилаз (HDACs), как звена эпигенетической регуляции гибели клеток при онко- и нейропатологиях.
Бета-амилоид (Aβ) и бета-секретаза: Изучение влияния на процесс агрегации бета-амилоида (одного из факторов, провоцирующих болезнь Альцгеймера) и ферментов участвующих в образовании токсичных фрагментов Aβ из белка предшественника АРР.
Работа с клеточными культурами: Исследование цитотоксических и цитостатических свойств тестируемых соединений.
Основателем и первым руководителем лаборатории синтеза физиологически активных веществ (1995-2019 гг.) был кандидат химических наук Владимир Борисович Соколов. Основным направлением исследований лаборатории были синтез и изучение превращений фторсодержащих фосфорорганических соединений, разработка методов синтеза разнообразных ациклических и гетероциклических соединений, синтез потенциальных физиологически активных веществ. В 2020 г. лаборатория была преобразована в группу синтеза физиологически активных веществ и по настоящее время группой заведует кандидат химических наук Алексей Юрьевич Аксиненко. E-mail: alaks@ipac.ac.ru
Основные направления исследований:
Разработка методов синтеза потенциальных лекарственных препаратов для лечения нейродегенеративных заболеваний на основе мультифармакофорных соединений, сочетающих в одной молекуле несколько базовых структурных фрагментов разных нейроактивных веществ.
Исследования по модификации нейропротекторов фармакофорными лигандами click-реакцией медь-катализируемого алкин-азидного 1,3-диполярного циклоприсоединения.
Исследования по объединению гетероциклических фармакофоров спейсерами различного типа – алкиленовым, 2-гидроксипропиленовым, оксоалкиленовым и другими типами.
Области исследований:
Разработка методов модификации физиологически активных веществ фармакофорами различных структурных типов для получения новых нейротропных препаратов:
модификация известных лекарственных препаратов, введением дополнительных фармакофорных фрагментов;
разработка методов синтеза новых гетероциклических структур;
применение разработанных методов синтеза новых гетероциклов на известных лекарственных препаратах.
Основные результаты:
Разработаны препаративные методы получения разнообразных ациклических и гетероциклических соединений: О-замещенных (в том числе фосфорилированных) ацилгидроксимоилхлоридов, циклических фосфоратов, фторсодержащих аминофосфонатов, триазинов, триазинонов, оксадиазинов, диазинов, диазинонов, фторимидазопиридинкарбоксилатов, оксазафосфолинов, 4-амино-5-оксодигидропирролов, имидазооксазолов.
Разработаны синтетические подходы к конъюгированию фармакофорных лигандов
Получены новые оригинальные нейропротекторы, часть из которых прошла или находится на стадии доклинических исследований: соединения «DF-302», «IPAC-2015» и «IPAC-2019»
Состав группы:
Аксиненко А.Ю. – ведущий научный сотрудник, к.х.н.
Замойский Владимир Лоллиевич – кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник
Габрельян Алексей Витальевич – научный сотрудник
Мезенцева Светлана Валентиновна – инженер
Драный Олег Александрович – начальник радиоизотопного блока
Основные направления исследований:
Поиск эффективных и безопасных блокаторов NMDA рецепторов нейронов ЦНС в качестве потенциальных лекарственных средств для профилактики и лечения нейродегенеративных и неврологических заболеваний.
Поиск позитивных модуляторов АМРА рецепторов в качестве нового класса когнитивных стимуляторов и нейропротекторов для создания лекарств для профилактики и лечения острых и хронических заболеваний, характеризующихся существенным ослаблением когнитивных функций и памяти.
Исследование соединений, влияющих на транспорт нейромедиатора глутамата в синаптических окончаниях нейронов мозга (высвобождение и обратный захват глутамата).
Изучение функциональных свойств и фармакологического профиля кальций управляемых хлорных каналов нейронов ЦНС как новое направление поиска лекарств для коррекции когнитивных нарушений и других патологий организма.
Изучение влияния новых соединений на ряд ионных каналов нейронов ЦНС – натриевых, калиевых – для комплексной оценки фармакологического профиля новых соединений.
Методы исследования
Биохимические методы исследования:
Оценка новых соединений в качестве блокаторов двух сайтов связывания NMDA рецепторов нейронов ЦНС с использованием радиолигандного метода.
Оценка новых соединений в качестве модуляторов транспортных систем глутаматергической передачи с использованием радиолигандного метода.
Электрофизиологические методы исследования:
Оценка новых соединений в качестве позитивных или негативных модуляторов АМРА рецепторов;
Оценка новых соединений в качестве блокаторов натриевых, калиевых каналов и кальций активируемых хлорных токов нейронов ЦНС.
Создание in vivo моделей, воспроизводящих ключевые звенья патогенеза нейродегенеративных заболеваний человека, для которых характерно нарушение метаболизма и функции определенных белков, обладающих повышенной склонностью к агрегации. Приобретение этими белками аберрантной конформации и их агрегация с последующим формированием нерастворимых патологических включений в тканях различных отделов нервной системы ведет к развитию протеинопатии и прогрессирующей нейродегенерации.
Формирование нерастворимых белковых включений, часто амилоидного типа, является важным элементом патогенеза многих распространенных нейродегенеративных заболеваний, например, болезни Альцгеймера, болезни Паркинсона, хореи Гентингтона, бокового амиотрофического склероза, ряда форм фронтотемпоральной дегенерации.
Все составляющие сложного процесса белковой агрегации, а также собственные защитные клеточные системы очистки от формирующихся и уже сформированных агрегатов являются потенциальными терапевтическими мишенями для разработки нового поколения лекарственных препаратов.
ПРОЕКТЫ ЛАБОРАТОРИИ:
■ Создание in vivo моделей, воспроизводящих ключевые звенья патогенеза нейродегенеративных заболеваний человека, для которых характерно нарушение метаболизма и функции определенных белков, обладающих повышенной склонностью к агрегации
■ Изучение функции длинной некодирующей РНК Neat1 в нервной системе с использованием генетически модифицированных мышиных моделей
■ Изучение молекулярных основ патогенеза бокового амиотрофического склероза. В сотрудничестве с кафедрой фундаментальной и клинической неврологии и нейрохирургии РГМУ им. Н.И.Пирогова
■ Моделирование составляющих нейродегенеративного процесса, связанных с истощением нормальной функции белков, вовлеченных в процесс патологической агрегации. Изучение физиологических функций белков семейства синуклеинов
■ Склонные к агрегации РНК-связывающие белки: механизмы патологической агрегации и роль в нейродегенерации
До 2008 г. — лаборатория фармакологии; с 1983 по 2007 г. заведующий лабораторией кандидат медицинских наук Владимир Васильевич Малыгин (1948–2007 гг.).
Махаева Галина Файвелевна
И.о. Заведующего лабораторией главный научный сотрудник, кандидат химических наук
Болтнева Наталья Павловна – кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник
Ковалева Надежда Владимировна – кандидат химических наук, старший научный сотрудник
Рудакова Елена Владимировна – кандидат химических наук, старший научный сотрудник
Серебрякова Ольга Георгиевна – научный сотрудник
Астахова Татьяна Юрьевна – кандидат химических наук, старший научный сотрудник (совместитель)
Лущекина Софья Владимировна – кандидат химических наук, старший научный сотрудник (совместитель)
Семенова Ольга Юрьевна – старший лаборант (совместитель)
Основные направления исследований:
поиск эффективных и безопасных ингибиторов холинэстераз как стимуляторов когнитивных функций и разработка на их основе мультитаргетных соединений как потенциальных препаратов терапии нейродегенеративных заболеваний, в том числе болезни Альцгеймера;
поиск селективных ингибиторов карбоксилэстераз для модуляции метаболизма лекарственных препаратов со сложноэфирными и амидными группами;
исследование биохимических основ и разработка методов ранней диагностики отставленной нейротоксичности, вызываемой фосфорорганическими соединениями (ОНТФОС);
разработка методов и средств оценки эстеразного статуса организма как комплексного биомаркера патологических состояний различной этиологии.
Методы исследования
Биохимические методы исследования:
оценка эстеразного профиля новых соединений – определение ингибиторной активности в отношении холинергических мишеней – ацетилхолинэстеразы (АХЭ) и бутирилхолинэстеразы (БХЭ) и структурно близкого фермента – карбоксилэстеразы (КЭ), включая взаимодействие с основными изоферментами hCES1 и hCES2;
оценка механизма ингибирования эстераз новыми соединениями – методы ферментативной кинетики;
оценка антиоксидантной активности соединений – методы ABTS, DPPH, FRAP, ORAC;
флуоресцентные методы исследования способности соединений блокировать АХЭ-индуцируемую агрегацию β-амилоида (по степени вытеснения пропидия – селективного лиганда периферического анионного сайта АХЭ) и самоагрегацию β-амилоида с использованием тиофлавина Т.
Методы компьютерного молекулярного моделирования:
молекулярный докинг в активные центры эстераз и β-амилоид с дополнительным использованием методов молекулярной динамики, квантовой механики и гибридного метода КМ/ММ;
И.о. руководителя группы кандидат химических наук, главный научный сотрудник E-mail: proshin@ipac.ac.ru Телефон: +7 496 524-26-11
Лаборатория была образована в 1991 году (зав. лаб. к.х.н. Ткаченко С.Е.). В конце декабря 2023 г. лаборатория специального органического синтеза преобразована в группу специального органического синтеза. Группа входит в состав Отдела биологической и медицинской химии ИФАВ РАН.
В рамках институтской программы по поиску нейропротекторов и стимуляторов когнитивных функций осуществлён синтез оригинальных лигандов глутаматных рецепторов NMDA- и AMPA-подтипов как потенциальных препаратов для терапии нейродегенеративных заболеваний. Работа по синтезу проводится в Отделе медицинской и биологической химии в тесном контакте с биологическими подразделениями Отдела. За последние десятилетия синтезированы и протестированы свыше тысячи оригинальных соединений различных классов.
Основные направления исследований:
Поиск и разработка методов синтеза оригинальных азотсодержащих ациклических и гетероциклических соединений.
Поиск и разработка методов синтеза гибридных мультитаргетных соединений.
Особый интерес у коллектива вызывают вещества, где одним из фармакофоров является NO-донорный фрагмент.
В настоящее время нами осуществляется синтез мультитаргетных соединений с различными спейсерами на основе отечественного антихолинэстеразного препарата Амиридин, разрешённого для терапии БА.
В последнее время коллектив принимал участие в выполнении следующих проектов:
Проект РФФИ 19-53-26016 Чехия_а «Гибридные структуры на основе амиридина как потенциальные мультитаргетные препараты терапии болезни Альцгеймера».
Проект РФФИ 20-03-00590 А «Создание мультифункциональных препаратов терапии болезни Альцгеймера на основе конъюгатов 4-амино-2,3-полиметиленхинолина и фенольных антиоксидантов».
Исследования проводятся в рамках плановой темы «Поиск и исследование механизмов действия нейропротекторов и стимуляторов когнитивных функций» со следующими номерами по Государственному заданию Института физиологически активных веществ РАН (ИФАВ РАН) за период 2018-2023 гг. – 0090-2017-0019, 0090-2019-0005, FFSN-2021-0005.
Сотрудники:
Серков Игорь Викторович – доктор хим. наук, ведущий научный сотрудник
Трофимова Татьяна Петровна – канд. хим. наук, научный сотрудник (совместитель)
Сергей Александрович Пухов – заведующий лабораторией, старший научный сотрудник, кандидат химических наук
Лаборатория природных соединений создана в 1995 году Приказом директора ИФАВ РАН от 30.10.1995 (№ 144-к раздел 3, п.1). C даты основания до 2022 года лабораторией руководил кандидат биологических наук Сергей Георгиевич Клочков. В настоящее время заведующим лабораторией является его ученик кандидат химических наук Сергей Александрович Пухов.
Основные направления исследований лаборатории
Химия природных соединений (выделение, очистка, установление структуры, химическая модификация)
Тестирование природных соединений на предмет проявления цитотоксических и цитостатических свойств по отношению к клеточными линиям млекопитающих, направленное на выявление соединений-хитов, предназначенных для использования в качестве противоопухолевых агентов.
Проекты лаборатории
В лаборатории выполняются работы в рамках Государственного задания ИФАВ РАН по теме “Медицинская химия как стратегия поиска новых биологически активных веществ на основе синтетических и природных соединений” (тема № FFSG-2024-0021, руководитель – академик С.О. Бачурин), а также при финансовой поддержке российских фондов по проектам, а также при финансовой поддержке российских фондов по проектам:
Карбонильные производные артемизинина – строительные блоки в синтезе новых биологически активных конъюгатов с аминами (проект РНФ № 23-23-00575); https://rscf.ru/project/23-23-00575/
Новые антинеопласты на основе антрациклиновых антибиотиков и сесквитерпеновых лактонов (проект РНФ № 19-73-00343); https://rscf.ru/project/19-73-00343/
Синтез активируемых в опухолевых клетках пролекарств на основе сесквитерпеновых лактонов (проект РФФИ № 18-33-00567 мол_а)
office@icp.ac.ru
+7 496 522-51-64
